Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP5C1P36542 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.6 ms