Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DUSP1P28562 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms