Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 HTR3B-201ENST00000260191 2011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VAMP1P23763 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms