Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1RP00736 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1RP00736 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1RP00736 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1RP00736 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1RP00736 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1RP00736 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1RP00736 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1RP00736 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms