Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX3O95343 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX3O95343 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX3O95343 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SIX3O95343 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SIX3O95343 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SIX3O95343 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SIX3O95343 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SIX3O95343 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SIX3O95343 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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SIX3O95343 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SIX3O95343 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SIX3O95343 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SIX3O95343 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SIX3O95343 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SIX3O95343 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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