Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FARP2O94887 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARP2O94887 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARP2O94887 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARP2O94887 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARP2O94887 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FARP2O94887 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms