Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA3O43365 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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