Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

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Length 811 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF839A8K0R7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF839A8K0R7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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