Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms