Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRRD1A4D1F6 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRD1A4D1F6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms