Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHANK2Q9UPX8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms