Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms