Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GOPCQ9HD26 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GOPCQ9HD26 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms