Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PCGF6Q9BYE7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCGF6Q9BYE7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms