Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGME1Q9BQP7 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms