Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms