Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NKD2Q969F2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms