Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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FAM71DQ8N9W8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71DQ8N9W8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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