Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATL3Q6DD88 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms