Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AP5B1Q2VPB7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AP5B1Q2VPB7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms