Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM187BQ17R55 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM187BQ17R55 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms