Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE3BQ13370 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PDE3BQ13370 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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