Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ACACAQ13085 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACACAQ13085 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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