Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC173Q0VFZ6 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms