Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms