Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TLE4Q04727 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms