Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TUBB4BP68371 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms