Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TAF6P49848 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms