Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRSS56P0CW18 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms