Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSF2P04141 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSF2P04141 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSF2P04141 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSF2P04141 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSF2P04141 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSF2P04141 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSF2P04141 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSF2P04141 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms