Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLGNO14967 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CLGNO14967 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms