Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFIP11Q9UBB9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms