Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CCDC180Q9P1Z9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC180Q9P1Z9 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms