Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUP58Q9BVL2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms