Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PCNX1Q96RV3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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