Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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