Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED9Q6R2W3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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