Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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