Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC96Q2M329 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms