Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIP13Q15645 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms