Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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