Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
CLINT1Q14677 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms