Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMS2P11Q13670 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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