Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDAP1Q13442 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 AC092810.1-201ENST00000429208 1224 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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