Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMD2Q13200 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms