Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HSPB3Q12988 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HSPB3Q12988 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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