Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNA1Q09470 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms