Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SPIBQ01892 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms