Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF2Q01130 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF2Q01130 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF2Q01130 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF2Q01130 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SRSF2Q01130 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms