Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP5P51878 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP5P51878 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP5P51878 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP5P51878 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP5P51878 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP5P51878 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP5P51878 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP5P51878 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms